管路及閥門本身的*滅菌是確保生物工程生產(chǎn)高效率的重要一環(huán)。生物工程工廠所選擇的閥門均應(yīng)利于清洗、維護(hù)和滅菌。由于隔膜閥具有嚴(yán)密的可靠、閥桿不與物料接觸的優(yōu)點(diǎn)，工廠多用隔膜閥。隔膜閥的特點(diǎn)有：1，僅有閥體和隔膜與物料接觸，其他部分全部隔離，可用蒸汽對閥門進(jìn)行*滅菌；2，具有自身排凈能力；3，可在線維修；4，管徑范圍大，基本滿足生物工程領(lǐng)域的需要。但隔膜間仍有縫隙是其缺點(diǎn)。
對隔膜閥進(jìn)行加熱蒸汽滅菌有以下三種形式；第二種是利用隔膜閥上面附加取樣用的或排污用的小閥，通過此小閥通入蒸汽或放出蒸汽冷凝水，也可使隔膜兩邊均充分滅菌；第三種是確保閥門接管的盲端管徑之比不大于6倍，且需保證管內(nèi)不積存冷凝水。后一種方法容易發(fā)生滅菌不*，故生產(chǎn)中很少采用。隔膜閥需定期檢查和更換。
為保證設(shè)備與管路的*滅菌，管路系統(tǒng)在設(shè)計安裝時，應(yīng)具有一定的斜度，通常取1：100或更大。其主要目的是確保蒸汽冷凝水排凈或不積聚；對于水平安裝的管道，一般在低點(diǎn)安裝排污閥，同時，為了避免管路較長時中間下垂而形成凹陷點(diǎn)，管路必須設(shè)有足夠的支撐點(diǎn)。
對于輸送較長的管路，為方便清洗和加熱殺菌，應(yīng)盡量減少管路并使之簡化，有些盡可能合并后與罐相連，彎頭、閥門等管件盡可能減少，同時盡可能減少高點(diǎn)和低點(diǎn)，且應(yīng)在每個低點(diǎn)設(shè)排閥；在高點(diǎn)設(shè)在加熱蒸汽進(jìn)氣管，這樣才能保證蒸汽殺菌的*性。
當(dāng)有多個罐時（如種子罐和發(fā)酵罐上連接的管路有接種管、空氣管、流加管、進(jìn)出料管和取樣管等），在使用前必須分段進(jìn)行滅菌（共同閥控制），保證蒸汽能夠達(dá)到所有需要滅菌的地方。于是，在管路系統(tǒng)的設(shè)計中就應(yīng)該考慮如何滿足滅菌要求和盡量減少死角，并確保在滅菌之后保持無菌狀態(tài)。當(dāng)培養(yǎng)基貯罐的已滅菌并冷卻至所需溫度的培養(yǎng)基藥送往滅菌后的空發(fā)酵罐中，先須對管路進(jìn)行滅菌（閥均關(guān)閉）。先依次打開各個閥門，然后開啟蒸汽閥，通入蒸汽進(jìn)行滅菌先關(guān)閉閥。殺菌結(jié)束。
